如果协议有明确条款说明盖章后生效，但只有法人代表签字，没盖公章，协议还不能生效。没有这个盖章后生效的条款，双方有法人代表签字，没盖公章，协议就已经生效。
对于合同生效所要满足的要件：
（一）行为人具有相应的民事行为能力。
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律或者社会公共利益。
只要法定代表人作为代表在合同上签字而不盖章没有违反上述规定，合同即生效。